据国家海洋局网站消息，2013年4月11日，国家海洋局发布了《国家海洋事业发展“十二五”规划》(以下简称规划)。规划共十八章，分别就海洋资源管理、海岛保护与开发、海洋生态保护和修复，以及海洋防灾减灾、海洋权益维护等方面作了说明。
《规划》有多个章节涉及海洋生态环境保护，并着重强调了进行海洋环境监测与评价的重要性。
《规划》强调加强海洋环境监测与评价，继续完善国家、省、市、县相结合的海洋环境监测体系，开展海洋环境监测机构标准化建设。推进海洋环境监测网络建设，提升装备能力和技术水平，实现对我国管辖海域各类环境要素的监测。建立海洋环境保护数据共享机制，深化海洋环境监测信息分析评价，完善海洋环境质量公告制度和环境状况通报制度。
《规划》强调对入海排污口、直排海污染源、重大海洋工程等加强海洋环境监测监督;对赤(绿)潮易发区、集中海水养殖区、重要滨海浴场、珍稀濒危海洋生物主要活动区域等直接关系到经济社会发展、公众健康安全、海洋生态安全的海域开展海洋环境质量监测。对海洋石油勘探开发实行定期巡航监测，定期发布通报。加强对持久性有机污染物、重金属、内分泌干扰物、生物毒素等的监测与评价。
《规划》强调了海洋生态保护的重要性，旨在通过加强海洋环境监测，以提高国家监管力度，从而实现海洋环境管理由事后管理向全过程监管转变。
此外，《规划》还提出将加强生物基因资源调查力度，开发深海生物资源利用技术。同时也将开展极地微生物基因资源的收集和应用评估。表明在“十二五”阶段，海洋微生物资源利用技术，海洋生物重要功能基因研究等研究方向将得到重点支持。这对于全面贯彻海洋生物资源可持续利用和协调发展的思想，积极推动海洋生物技术的科技创新具有重要意义。
